מערך התחבורה הציבורית במדינת ישראל מתפרס על פני נותני שירות רבים הפועלים ברישיון משרד התחבורה. מלבד מערכת הרכבות הפועל בתחומי מדינת ישראל פועלות גם כמה וכמה חברות תחבורה ציבורית כמו אגד, דן וחברת נתיב אקספרס המפעילות מערך אוטובוסים ייעודי לתחבורה ציבורית.
אפיקים תחבורה ציבורית זוהי חברת תחבורה ציבורית ישראלית הנמצאת בבעלות משותפת של חברת עילית קווי תחבורה ומנון מסילות בע"מ. אפיקים תחבורה ציבורית נוסדה בשנת 2008 כשהיא מפעילה קווי אוטובוסים באור גוש דן והשומרון.